Detalhe da pesquisa
1.
Domain Evolution of Vertebrate Blood Coagulation Cascade Proteins.
J Mol Evol;
90(6): 418-428, 2022 12.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE
| ID: mdl-36181519
2.
DOGMA: a web server for proteome and transcriptome quality assessment.
Nucleic Acids Res;
47(W1): W507-W510, 2019 07 02.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE
| ID: mdl-31076763
3.
The modular nature of protein evolution: domain rearrangement rates across eukaryotic life.
BMC Evol Biol;
20(1): 30, 2020 02 14.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE
| ID: mdl-32059645
4.
Multiple sequence alignment modeling: methods and applications.
Brief Bioinform;
17(6): 1009-1023, 2016 11.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE
| ID: mdl-26615024
5.
Remodeling of the juvenile hormone pathway through caste-biased gene expression and positive selection along a gradient of termite eusociality.
J Exp Zool B Mol Dev Evol;
330(5): 296-304, 2018 07.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE
| ID: mdl-29845724
6.
Epistasis as the primary factor in molecular evolution.
Nature;
490(7421): 535-8, 2012 Oct 25.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE
| ID: mdl-23064225
7.
Alignathon: a competitive assessment of whole-genome alignment methods.
Genome Res;
24(12): 2077-89, 2014 Dec.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE
| ID: mdl-25273068
8.
DOGMA: domain-based transcriptome and proteome quality assessment.
Bioinformatics;
32(17): 2577-81, 2016 09 01.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE
| ID: mdl-27153665
9.
How Do Genomes Create Novel Phenotypes? Insights from the Loss of the Worker Caste in Ant Social Parasites.
Mol Biol Evol;
32(11): 2919-31, 2015 Nov.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE
| ID: mdl-26226984
10.
SARA-Coffee web server, a tool for the computation of RNA sequence and structure multiple alignments.
Nucleic Acids Res;
42(Web Server issue): W356-60, 2014 Jul.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE
| ID: mdl-24972831
11.
MDAT- Aligning multiple domain arrangements.
BMC Bioinformatics;
16: 19, 2015 Jan 28.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE
| ID: mdl-25626688
12.
Domain similarity based orthology detection.
BMC Bioinformatics;
16: 154, 2015 May 13.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE
| ID: mdl-25968113
13.
Using tertiary structure for the computation of highly accurate multiple RNA alignments with the SARA-Coffee package.
Bioinformatics;
29(9): 1112-9, 2013 May 01.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE
| ID: mdl-23449094
14.
STRIKE: evaluation of protein MSAs using a single 3D structure.
Bioinformatics;
27(24): 3385-91, 2011 Dec 15.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE
| ID: mdl-22039207
15.
Upcoming challenges for multiple sequence alignment methods in the high-throughput era.
Bioinformatics;
25(19): 2455-65, 2009 Oct 01.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE
| ID: mdl-19648142
16.
A Roadmap to Domain Based Proteomics.
Methods Mol Biol;
1851: 287-300, 2019.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE
| ID: mdl-30298404
17.
Hemimetabolous genomes reveal molecular basis of termite eusociality.
Nat Ecol Evol;
2(3): 557-566, 2018 03.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE
| ID: mdl-29403074
18.
Transposable element islands facilitate adaptation to novel environments in an invasive species.
Nat Commun;
5: 5495, 2014 Dec 16.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE
| ID: mdl-25510865
19.
Using the T-Coffee package to build multiple sequence alignments of protein, RNA, DNA sequences and 3D structures.
Nat Protoc;
6(11): 1669-82, 2011 Nov.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE
| ID: mdl-21979275